הבני-הנוער נשלחים למרפאה מלשכות הרווחה והמחלקה לנוער בסיכון של עיריית ירושלים. במרפאה מתנדבים רופאי שיניים מלמעלה מ-20 ארצות, רבים מהם מומחים בתחומם, ויחד עם הצוות הישראלי מבצעים כ-1,200 טיפולים בחודש. מאז היווסדה, התנדבו במרפאה יותר מ-4,500 רופאי שיניים מישראל והעולם.  למרפאה שמפעילה עמותת "רופאי שיניים מתנדבים לישראל" מגיעים ילדי ירושלים הנצרכים ובני-נוער בסיכון, לקבלת טיפולי שיניים ולביקורות שגרתיות מדי חצי שנה. הטיפולים ניתנים ללא תשלום, ובפיקוח של מומחים ברפואת שיניים. המטופלים נמצאים במעקב מגיל 4 עד 26. בנוסף, אגף החינוך לבריאות הפה והשיניים של המרפאה מפעיל תוכנית לבריאות הפה, בה משתתפים מאות ילדים והורים מדי חודש. טרם הטיפול, כל ילד המגיע למקום עובר הדרכה אצל השיננית, והילדים והוריהם לומדים לשמור על ניקיון השיניים ואודות הרגלי אכילה נכונים.