תכנית לימודית שיקומית – שישה ימים בשבוע: בתכנית זו מודגשות טכניקות האוריינטציה והניידות, כמו גם אוריינות בסיסית ואינטראקציה חברתית. התכנית מאפשרת לכל ילד לממש את מלוא הפוטנציאל האישי שלו. בתכנית נכללים גם טיפולי פיזיותרפיה, ריפוי בעיסוק, ריפוי בדיבור, תרפיה במוזיקה, הידרותרפיה, רכיבה טיפולית, שיאצו, מסאז' וטיפול באמצעות בעלי חיים.
תכנית לאם ולילד: פעם בשבוע אלי"ע מפעילה תכנית תרפיה, תמיכה וייעוץ לתינוקות עד גיל שנה ואמהותיהם.
תכנית תמיכה למשפחות: לאלי"ע תפקיד מרכזי בהתפתחותו של כל ילד, אולם המשפחה מהווה את מקור התמיכה העיקרי של הילד העיוור או לקוי הראיה. משאבים רבים מופנים בכל הסניפים לפגישות ייעוץ פרטניות וקבוצתיות למשפחות, בהנחיית אנשי מקצוע בכירים.
הידרותרפיה: בספטמבר 2003 הקימה אלי"ע מרכז הידרותרפיה בצמוד לסניף פתח תקווה. הבריכה משרתת את כל ילדי הסניף במשך כל השנה, אחת לשבוע. ילדי סניפים ירושלים ובאר שבע נהנים מפעילות הידרותרפית דומה בבריכות שמחוץ לסניפים.
קייטנה לבוגרי אלי"ע.
תוכנית הערכה והדרכה למסגרות חיצוניות.