עמותת מקלט הקופים הישראלי הוקמה בשנת 1996 ופועלת להצלה ושיקום של קופים בישראל. אלו קופים שיצאו מהמעבדות לאחר ניסויים, קופים שהוברחו ארצה והוחזקו כחיות מחמד בניגוד לחוק, נסחרו בניגוד לחוק או קופים שגודלו בתנאים בלתי הולמים.
כל הקופים במקלט סבלו טראומות רבות ושונות. מעבר לטראומה הפיזית שחוו הקופים בניסויים, כל הקופים במקלט הם קורבנות של התעללות או הזנחה מסוג כלשהו. רבים מהם נלקחו מהוריהם בכוח בהיותם גורים ומעולם לא זכו לגדול בחברת קופים. חלקם גודלו במשך שנים רבות בתת-תנאים, בכלובים קטנים מאוד, ללא אוכל מתאים או טיפול רפואי הולם. במקלט אנו מעניקים להם את הדרוש לבריאותם הפיזית והנפשית: טיפול רפואי ותזונה ראויה, מרחב מחיה מתאים ובעיקר חיים בחברת קופים אחרים.
הידע וניסיון שנרכש במהלך 25 שנות הצלה ושיקום מציבים את מקלט הקופים הישראלי בשורה הראשונה של המקלטים לקופים בעולם.
עד היום נקלטו במקלט מעל 1000 קופים. העמותה פעלה רבות על מנת לצמצם את כמות הקופים שזקוקים לעזרה בישראל: יזמה והוציאה לפועל פרויקט בקרה על ילודה בכל פינות חי, והייתה שותפה בהגדרת תקנות אחזקת קופים בשבייה ביחד עם רשות הטבע והגנים. אך העבודה טרם הושלמה וקופים במצוקה ממשיכים להגיע כל הזמן.
המקלט עובד בשיתוף פעולה עם המשרד להגנת הסביבה, רשות הטבע והגנים והמשטרה. כמו כן המקלט מוכר כמתקן מוגן על פי סעיף 8 (ג) לחוק צער בעלי חיים.